经过处理的种子播种后一般在20天陆续出苗，为培育壮苗，必须加强管理。防止日灼。幼苗刚出时，如遇高温曝晒的天气，嫩芽先端易枯焦或幼苗被压弯，应及时将平铺地面的塑料膜改为小拱棚，并经常观测棚内温度变化，保持棚内温度不超过30c，湿度保持80%以上，当苗木大部分出土，应进行通风炼苗，逐渐撤掉塑膜。
间苗移苗。幼苗长到5―10cm时，要进行间苗定苗。为了培育壮苗，株距保持5cm左右，每亩定苗2―3万株。间苗后的幼苗，可连土移到缺苗的地方，也可移到别的苗床培育，移栽时间以幼苗3―5片真叶时为好。在移栽前2―3天进行灌水，以利挖苗保根，阴天或傍晚移栽可提高成活率。随采随播苗木，于次年春季萌芽后进行间苗定株，使苗距保持在5cm左右。
中耕除草：中耕可疏松土壤，减少蒸发、杂草，防止土壤板结，有利于苗木生长。在苗木生长期内应中耕3―4次，使苗圃地保持土壤疏松无杂草。

另一种是用50%碱水浸泡15~20分钟，水温30~40℃，捞出后，用清水冲洗几次，再用草木灰或粗砂反复揉搓直至种子表面呈灰白色为止，然后用清水洗净，梢凉即可播种。花椒的适应性强,管理容易,房前屋后均可栽植。 花椒播种育苗既有春播又有秋播。经各地实践证明,秋播比春播有以下几点好处:一是秋播花椒免去了种子催芽的程序,种子自然发芽,一次出齐,抗逆性强。
是能提高植株的抗病能力。秋播的花椒,一般在翌春3月下旬或4月上旬出齐,当外界气温剧烈变化时,幼苗已具备了一定的适应能力。三是秋播花椒不需追肥。花椒秋播比春播提前出土10～15天,这样苗木速生期来得早,形成完整的根系也早,能从土壤中吸取头一年整地时施用的有机肥。
对于北方北京以北地区一般是春季地皮解冻后栽植比较好。黄河以北地区一般在秋冬季节核桃树苗落叶后到翌年开春后花椒苗发芽之前都可种植；中南部地区提倡秋冬季节种植比较好。因为北方特别寒冷的地方冬季种植有的需要采取防寒措施,比较麻烦,所以春季种植较好。而北方不太寒生长发芽,对来年生长有很大的帮助。所以各个地区应根据自己的实际情况酌情考虑。